De belangrijkste routes vanuit de haven van Heraklion zijn:
Heraklion-Lasithi (Chersonissos-Malia-Ag.Nikolaos-Ierapetra-Sitia-Viannos-Monofatsi)
Heraklion - Chersonisos - Stalida - Malia
Heraklion - Airport - Agios Nikolaos - Ierapetra
Heraklion - Airport - Agios Nikolaos - Sitia
Heraklion - Sissi - Milatos
Heraklion - Lasithi Plateau
Heraklion - Archanes
Heraklion - Agia Pelagia
Heraklion - Viannos
Agios Nikolaos - Elounda - Plaka
Agios Nikolaos - Kritsa
Ierapetra - Sitia
Sitia - Palekastro - Zakros
Sitia - Vai
Heraklion-Messara (Messara-Milopotamos-Malevizi), vanuit Chanioporta.
Heraklion - Faistos
Heraklion - Matala
Heraklion - Tympaki - Agia Galini
Heraklion - Lentas
Heraklion - Anogia
Heraklion - Moires
Ook vanuit de haven van Heraklion vertrekt ieder uur de toeristisch belangrijke lijn naar Rethymno en Chania.
Vervolgens kunt u natuurlijk gemakkelijk vanuit deze plaatsen uw weg vervolgen.
Chania - Rethymnon
Chania - Omalos (Samaria)
Chania - Sfakia
Chania - Sougia
Chania - Kissamos - Palaiochora
Chania - Therisso
Chania - Kolymbari - Kissamos - Falasarna
Chania - Elafonisi
Chania - Kalyves - Almyrida
Rethymno - Amari
Rethymno - Agia Galini
Rethimnon - Plakias - Preveli
Rethymno - Arkadi
Rethymno - Anogia
Rethymno - Elafonisi
Rethymno - Rodakino - Sfakia
Rethymno - Omalos
Rethymno - Panormo.